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三维重建要求相邻的层与层之间影像准确重叠，理想的情况是受检者在扫描自始至终没有任何移动。所以胸、腹部的扫描，应尽量缩短扫描持续时间，使扫描能在一次摒气内完成，以消除呼吸运动带来的层间移动；不能摒气的病人，应嘱其平静呼吸。胸部检查时，心脏附近的位移可达1cm，EBCT采用心电门控使每层图像都在同一心电时相上，消除了心跳带来的层间移动，从而能很准确地重叠。心律不齐的病人，心电门控失效，心脏区域的三维图像会受到影响，产生横纹。
EBCT检查采用Imatron电子束CT C－150L，连续容积去肋骨伪影扫描（Conc－Beam）程序，130kV，610－620mA，512*512矩阵，重叠重建，造影增强时以3－4ml/s速率注射造影剂，采用Ultra access重建软件处理，依据程序要求选择阈值130－150进行计算，完成图像重建。
1、脑血管：400ms/层，层厚1.5－3mm，间隔1.5mm，造影剂80－100ml，自颅底扫描到侧脑室体部上方；
2、胸部或腹部主动脉和肺动脉：200或400ms/层，3或6mm层厚，造影剂60－70ml，自胸廓入口扫描至膈肌或自膈肌扫描到髂外动脉平面；
3、主动脉全程：200ms/层，6－8mm层厚，造影剂80－100ml，自胸廓入口扫描至髂外动脉平面；
4、冠状动脉：100ms/层，80％的心电R－R间期同步触发，层厚3mm，重叠2mm，120－140ml造影剂；自气管分叉下左冠状动脉开口上扫描到心脏底部，共扫描40－60层；
5、先天性心脏病：100－200ms/层，层厚3mm，自主动脉弓部扫描到心脏底部；同时还需做心脏长轴血流和心动电影扫描。扫描所得图像传输到工作站，采用SSD、MIP、容积呈现（VRT）和MPR对二维横断面图像处理重建。
6、肾动脉：200－400ms/层，层厚3
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